La junta directiva está conformada por seis miembros, de los cuales dos son delegados de entidades cívicas o ligas de usuarios de la ciudad, como representantes de la comunidad.
EMSA desarrolla su actividad principal en el mercado de los juegos de suerte y azar, especialmente la Lotería de Manizales.
La Alcaldía de Manizales convoca a las entidades cívicas o ligas de usuarios de la ciudad para que deleguen sus representantes principal y suplente ante la junta directiva de la Empresa Municipal para la Salud (EMSA).
La convocatoria se hace mediante la Resolución 0050 de 2 de febrero del 2024, en la que se extiende la invitación para que, en un término de 30 días, los convocados escojan a sus delegados principales con sus respectivos suplentes personales. Estos serán designados por el alcalde mediante decreto, en los términos de Ley.
Los nombres y hojas de vida de los ciudadanos escogidos o postulados serán recibidos en la Alcaldía de Manizales en la ventanilla única.